中国科学院水生所在长链非编码RNA的分子作用机制研究方面取得重要进展

    长链非编码RNA(Long non-coding RNA, lncRNA)是长度大于 200 个核苷酸的非编码 RNA。研究表明，lncRNA作为一种重要的基因调控模式参了多种生物过程例如表观遗传调控、细胞周期调控、肿瘤发生和转移等。通过研究lncRNA的生物学功能及其在疾病中的调控机制，能够更加全面深入地理解疾病发生的分子机理，并有望发现新的疾病诊断标志物以及治疗靶点，是目前生命科学领域的研究热点。

　　中国科学院水生所葛峰课题组采用基于生物质谱分析的体内标记定量蛋白质组学技术，系统、深入地研究了一种重要的肿瘤相关LncRNA即HOTAIR的蛋白调控网络；将SILAC（stable isotope labeling by amino acids in cell culture）方法应用于lncRNA的功能研究中，构建了HOTAIR的蛋白调控网络（图1），生物信息学分析发现HOTAIR参与调控多种重要生物学过程，尤其是细胞骨架和线粒体相关的生理活动。深入的功能研究结果表明，HOTAIR可以通过上调一种关键的细胞骨架蛋白—vimentin (VIM)的表达来调控肿瘤细胞的迁移和侵袭.抑制HOTAIR的表达还会导致线粒体的功能紊乱以及超微结构的变化，提示HOTAIR的正常表达在维持癌细胞线粒体功能方面也起着重要作用。通过整合定量蛋白质组学和功能研究的结果，提出了HOTAIR调控肿瘤细胞迁移和侵袭的分子机制模型（图2）。研究结果表明，SILAC技术是系统研究和鉴定非编码RNA的调控蛋白网络和功能靶标的高效且可靠的方法，可以从动态和整体的角度阐明细胞或生物体非编码RNA的蛋白调控网络和分子作用机制，有望成为非编码RNA功能研究的不可或缺的工具。该研究成果已经在线发表在国际蛋白质组学专业杂志Molecular & Cellular Proteomics上。文章链接: http://www.mcponline.org/content/early/2015/03/11/mcp.M114.043984.long

　　该研究得到了国家自然科学基金面上项目（31370746）的资助。

　　图1.基于SILAC的定量蛋白质组学技术研究一种长链非编码RNA的蛋白调控网络的实验路线及结果.

　　图2.通过整合定量蛋白质组学和细胞实验以及动物实验的结果，提出了一种长链非编码RNA-HOTAIR调控肿瘤细胞迁移和侵袭的分子机制模型.